O ministério espanhol da Economia, Indústria e Competitividade atribui os certificados Severo Ochoa e María de Maeztu a centros e unidades de investigação de excelência, respetivamente, em todos os domínios da ciência. É a distinção mais alta a nível nacional para entidades que promovem a excelência no âmbito da investigação. Estes certificados de excelência são atribuídos com base numa competição anual entre um pequeno número de entidades durante um número de anos limitado. Quando o período de validade dos certificados atribuídos termina, as entidades têm de se submeter novamente a um processo de seleção competitivo a fim de renovar os seus certificados.
A maior parte da investigação científica em Portugal é levada a cabo em Unidades de I&D e Laboratórios Associados, financiados e avaliados pela FCT (Fundação para a Ciência e a Tecnologia). Existem atualmente 307 Unidades de I&D acreditadas onde trabalham cerca de 22 000 investigadores.
A investigação realizada nestas instituições abarca todos os domínios científicos, desde as ciências da vida e da saúde às ciências sociais e humanas, passando pelas engenharias, ciências exatas, ciências naturais e do ambiente. As instituições são avaliadas regularmente pela FCT.